Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NAP1L3Q99457 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NAP1L3Q99457 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NAP1L3Q99457 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms