Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHOX2BQ99453 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHOX2BQ99453 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHOX2BQ99453 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms