Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNFRSF13CQ96RJ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms