Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXN4Q96NZ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXN4Q96NZ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXN4Q96NZ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN4Q96NZ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms