Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC7Q96NW7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRRC7Q96NW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC7Q96NW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LRRC7Q96NW7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LRRC7Q96NW7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LRRC7Q96NW7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LRRC7Q96NW7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LRRC7Q96NW7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
LRRC7Q96NW7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LRRC7Q96NW7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LRRC7Q96NW7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
LRRC7Q96NW7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
LRRC7Q96NW7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms