Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC138Q96M89 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC138Q96M89 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC138Q96M89 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms