Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC7Q96M83 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC7Q96M83 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC7Q96M83 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC7Q96M83 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC7Q96M83 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC7Q96M83 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms