Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL48Q96GC5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL48Q96GC5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL48Q96GC5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms