Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP36Q96G28 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP36Q96G28 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP36Q96G28 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP36Q96G28 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP36Q96G28 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms