Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJA3Q96EY1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJA3Q96EY1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJA3Q96EY1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms