Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
GCC1Q96CN9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GCC1Q96CN9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GCC1Q96CN9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms