Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TIFAQ96CG3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIFAQ96CG3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIFAQ96CG3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 920.6 ms