Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN23Q96B33 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN23Q96B33 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN23Q96B33 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN23Q96B33 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms