Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FUBP1Q96AE4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FUBP1Q96AE4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FUBP1Q96AE4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms