Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOP1MTQ969P6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP1MTQ969P6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP1MTQ969P6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms