Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF34Q969K3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF34Q969K3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF34Q969K3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF34Q969K3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF34Q969K3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.7 ms