Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS3Q969F9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS3Q969F9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS3Q969F9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms