Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP13Q92995 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP13Q92995 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP13Q92995 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP13Q92995 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP13Q92995 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP13Q92995 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP13Q92995 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP13Q92995 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP13Q92995 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP13Q92995 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP13Q92995 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP13Q92995 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP13Q92995 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP13Q92995 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP13Q92995 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP13Q92995 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USP13Q92995 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP13Q92995 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP13Q92995 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP13Q92995 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP13Q92995 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP13Q92995 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP13Q92995 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP13Q92995 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP13Q92995 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USP13Q92995 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP13Q92995 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP13Q92995 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP13Q92995 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP13Q92995 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP13Q92995 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP13Q92995 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP13Q92995 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP13Q92995 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP13Q92995 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP13Q92995 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP13Q92995 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP13Q92995 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP13Q92995 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP13Q92995 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP13Q92995 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP13Q92995 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP13Q92995 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP13Q92995 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP13Q92995 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP13Q92995 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP13Q92995 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP13Q92995 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP13Q92995 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP13Q92995 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP13Q92995 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP13Q92995 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP13Q92995 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP13Q92995 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP13Q92995 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP13Q92995 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP13Q92995 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP13Q92995 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP13Q92995 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP13Q92995 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP13Q92995 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP13Q92995 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP13Q92995 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP13Q92995 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP13Q92995 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP13Q92995 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP13Q92995 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP13Q92995 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP13Q92995 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP13Q92995 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP13Q92995 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP13Q92995 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP13Q92995 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP13Q92995 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP13Q92995 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP13Q92995 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP13Q92995 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP13Q92995 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP13Q92995 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP13Q92995 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP13Q92995 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP13Q92995 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP13Q92995 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP13Q92995 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP13Q92995 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP13Q92995 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP13Q92995 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP13Q92995 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP13Q92995 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP13Q92995 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP13Q92995 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP13Q92995 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP13Q92995 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP13Q92995 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP13Q92995 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP13Q92995 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP13Q92995 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP13Q92995 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP13Q92995 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms