Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRF1Q92994 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRF1Q92994 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
BRF1Q92994 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms