Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLP1Q92989 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLP1Q92989 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CLP1Q92989 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLP1Q92989 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms