Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX13Q92968 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX13Q92968 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX13Q92968 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX13Q92968 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms