Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
DPF3Q92784 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
DPF3Q92784 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DPF3Q92784 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms