Protein–RNA interactions for Protein: Q92698

RAD54L, DNA repair and recombination protein RAD54-like, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54LQ92698 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD54LQ92698 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD54LQ92698 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD54LQ92698 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD54LQ92698 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD54LQ92698 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD54LQ92698 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD54LQ92698 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD54LQ92698 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD54LQ92698 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RAD54LQ92698 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAD54LQ92698 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD54LQ92698 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD54LQ92698 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD54LQ92698 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD54LQ92698 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD54LQ92698 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54LQ92698 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54LQ92698 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54LQ92698 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54LQ92698 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54LQ92698 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms