Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PYDC1Q8WXC3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PYDC1Q8WXC3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PYDC1Q8WXC3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYDC1Q8WXC3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms