Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK2

SNRNP27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP27Q8WVK2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNRNP27Q8WVK2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRNP27Q8WVK2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP27Q8WVK2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP27Q8WVK2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms