Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TWIST2Q8WVJ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TWIST2Q8WVJ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TWIST2Q8WVJ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWIST2Q8WVJ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.1 ms