Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRN4Q8WUT4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRN4Q8WUT4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRN4Q8WUT4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRN4Q8WUT4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRN4Q8WUT4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRN4Q8WUT4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRN4Q8WUT4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRN4Q8WUT4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRN4Q8WUT4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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