Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP1Q8TDR0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAF3IP1Q8TDR0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP1Q8TDR0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP1Q8TDR0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP1Q8TDR0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP1Q8TDR0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms