Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTRT1Q8TDG2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTRT1Q8TDG2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTRT1Q8TDG2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ACTRT1Q8TDG2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTRT1Q8TDG2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTRT1Q8TDG2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTRT1Q8TDG2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms