Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRSK1Q8TDC3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRSK1Q8TDC3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRSK1Q8TDC3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRSK1Q8TDC3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms