Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC8Q8TC99 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNDC8Q8TC99 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FNDC8Q8TC99 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms