Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIPK4Q8NE63 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK4Q8NE63 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIPK4Q8NE63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIPK4Q8NE63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIPK4Q8NE63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIPK4Q8NE63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIPK4Q8NE63 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIPK4Q8NE63 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIPK4Q8NE63 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms