Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDV1

ST6GALNAC3, Alpha-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST6GALNAC3Q8NDV1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ST6GALNAC3Q8NDV1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ST6GALNAC3Q8NDV1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ST6GALNAC3Q8NDV1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ST6GALNAC3Q8NDV1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ST6GALNAC3Q8NDV1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ST6GALNAC3Q8NDV1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ST6GALNAC3Q8NDV1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.7 ms