Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDPRQ8NCN5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDPRQ8NCN5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDPRQ8NCN5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms