Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD9Q8NBP5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MFSD9Q8NBP5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD9Q8NBP5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms