Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RDH13Q8NBN7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RDH13Q8NBN7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RDH13Q8NBN7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RDH13Q8NBN7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms