Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
COLGALT1Q8NBJ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COLGALT1Q8NBJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COLGALT1Q8NBJ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COLGALT1Q8NBJ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms