Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL23Q8NBE8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL23Q8NBE8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KLHL23Q8NBE8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL23Q8NBE8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms