Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP38Q8NB14 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP38Q8NB14 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP38Q8NB14 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP38Q8NB14 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP38Q8NB14 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms