Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF3Q8N9W5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF3Q8N9W5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAAF3Q8N9W5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF3Q8N9W5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms