Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR7Q8N806 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBR7Q8N806 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBR7Q8N806 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UBR7Q8N806 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UBR7Q8N806 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBR7Q8N806 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBR7Q8N806 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBR7Q8N806 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UBR7Q8N806 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
UBR7Q8N806 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR7Q8N806 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms