Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSGALNACT2Q8N6G5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSGALNACT2Q8N6G5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSGALNACT2Q8N6G5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSGALNACT2Q8N6G5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms