Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHCHD4Q8N4Q1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHCHD4Q8N4Q1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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