Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHTF2Q8N3S3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHTF2Q8N3S3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHTF2Q8N3S3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHTF2Q8N3S3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms