Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP3Q8IZU3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP3Q8IZU3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP3Q8IZU3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP3Q8IZU3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP3Q8IZU3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP3Q8IZU3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP3Q8IZU3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP3Q8IZU3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP3Q8IZU3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP3Q8IZU3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP3Q8IZU3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP3Q8IZU3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP3Q8IZU3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP3Q8IZU3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP3Q8IZU3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms