Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC49Q8IUZ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC49Q8IUZ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC49Q8IUZ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC49Q8IUZ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC49Q8IUZ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC49Q8IUZ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC49Q8IUZ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC49Q8IUZ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC49Q8IUZ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms