Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX29P2Q8IUI4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX29P2Q8IUI4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX29P2Q8IUI4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms