Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMPRSS6Q8IU80 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMPRSS6Q8IU80 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMPRSS6Q8IU80 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms