Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG4Q86SJ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSG4Q86SJ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG4Q86SJ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG4Q86SJ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG4Q86SJ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG4Q86SJ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG4Q86SJ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms