Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLNKQ7Z7G1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLNKQ7Z7G1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLNKQ7Z7G1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms